車臣獨立運動分兩條主要路線：一是民族主義者，訴求是建立政教分離的世俗民主國家；一是伊斯蘭原教旨主義者，訴求是建立伊斯蘭神權國家。前者代表人物是一九九七年就職的民選總統馬斯哈多夫，後者代表人物是被馬斯哈多夫邀請加入內閣，但未幾即不歡而散的巴薩耶夫。
政教分離的世俗民主國家體制，乃歐美國家主流。但原教旨主義者對此體制一直抱懷疑、鄙視態度，認為民主只屬人的體制，並非按伊斯蘭教義建立神的體制。
事實上，原教旨主義只有伊斯蘭社群，並無國家觀念，信服真神律法的社群屬全球一體，不分種族，無分國界。他們反對為獨立而獨立，甚至認為以民族主義及民主建立國家，比不獲獨立更差，蓋因他們視民族區分、民主自決皆西方陰謀，旨在窒礙伊斯蘭社群發展。
巴薩耶夫及其阿拉伯世界支持者，計劃透過軍事行動擊敗俄羅斯，在高加索地區建立包括車臣、印古什、達吉斯坦等地的「高加索伊斯蘭共和國」，與中東沙特阿拉伯看齊。一九九一年策動入侵達吉斯坦，導致俄羅斯再次出兵車臣；二○○二年劫持莫斯科歌劇院，害死一百二十九名人質，轟動一時，車臣乃恐怖主義溫床之惡名不脛而走。這些行動傷害俄羅斯，更傷害走溫和路線的車臣民族主義者，他們建立民主國家的訴求已被全球反恐洪流淹沒，無人再相信他們有能力駕馭兇險的國情，恐難有東山再起之日。