馬英九政府上台以來，在內政上推動了新行政區域的劃分，才有今日升格的五都選舉。當政者的任何政策推動，除了着眼於未來發展，當然亦有政黨層面的考量。不過，五都的重新劃定沒有為國民黨帶來利益，反而使它陷於苦戰。
現在，馬英九政府又推出新政策，要實施不在籍投票。目前的選舉都依戶籍所在地而定其投票場所，因之投票日定在周末，讓外地選民可返鄉投票；推動不在籍投票就是為了便民，讓在外地工作的民眾可在工作地投票。事實上，各界多年來一直探討此問題，卻總在爭議中罷休，現在內政部強力推出，獲眾多民眾支持，此舉除了便民外，更可擴大公民參與。然而，不在籍投票並不涉及海外僑民的投票問題，僑民還是得飛回台灣投票。每逢大選，各地僑胞和台商紛紛返台，熱鬧非常。
在台灣泛政治的社會裏，任何議題都會有爭議，這項便民措施就遭到綠營撻伐，認為是偷步之舉，尤其在下屆總統大選時實施，難免有為助馬英九連任之嫌。蔡英文認為，總統大選是敏感選舉，公正性要求亦高，不在籍投票是台灣選舉史上的重大變革，即刻在下次總統大選時實施會引起許多爭議，實不盡恰當。
不在籍投票主要針對的對象乃軍、警、公務員或受刑人，多為藍營背景，他們的投票意向易受到政治力介入或上級操控。估計不在籍投票影響一百萬人，實是選舉的重大關鍵。綠營抨擊此政策影響選舉的公平性，使得大選陷入紛爭，動搖台灣民主基礎。
民主國家早就已經實施不在籍投票，惟台灣朝野沒有互信基礎，紛擾不斷。改革制度不應有政黨盤算，朝野都應撇開政治利益考慮，才能深化民主機制，讓民主繼續向前行。