國民黨主席補選，洪秀柱當上國民黨百年歷史的首位女主席，她被視為深藍的統派，與本土派格格不入。早在去年洪秀柱欲競選總統，提出「一中同表」之主張，被視為趨統的路線，讓本土派反撲，以退出立法委員選舉為要挾，逼黨中央無情「換柱」。現洪秀柱在歷史新低的投票率下當選，將被本土派視為代表性不足，不願屈服於洪秀柱的領導而蠢蠢欲動，頗有再度分裂出走的可能。
洪秀柱個性剛毅，對於她主張的路線十分堅定，她推動「一中同表」的統一路線時，矛盾將會深化，甚而本土派不惜以出走來再度要挾黨中央。正所謂「道不同，不相為謀」，國民黨敗選之後氣勢已弱，令人憂心將面臨另一次分裂。
依這次主席補選的過程來看，只有四成多的低投票率，顯示國民黨黨員對黨失去了向心力，心灰意冷提不起熱忱。出來投票的主要是與洪秀柱路線理念相近的黃復興黨部，主導了洪秀柱勝選的關鍵。黃復興黨部眷村票大都是七老八十的老黨員，他們必會支持洪秀柱貫徹趨統路線。
而今洪秀柱及國民黨無法獲得年輕選民的支持，一般來說，年輕人與台灣社會結構屬性是一致的，洪秀柱要將黨內的年輕人團結起來是困難重重，現又面臨民進黨的追討黨產，沒有黨產缺乏了黨的凝聚力，國民黨內沒鬥志，對本土派沒有凝聚力，怎麼能不分裂呢？
現中南部基層黨員表達對黨失去了信心，與洪秀柱理念不一致，因而有退黨潮。
洪秀柱手中無牌，沒有黨資源，加上路線之爭，與本土派感情不深，沒有相同理念的基礎，很難把本土派團結起來。此外，與王金平又有嫌隙，大老們都作壁上觀，柱柱姐面對黨的分裂也無能為力，挽救不了分裂的危機。