馬英九在大選後已成跛腳總統，台灣政壇正式走入後馬英九時代，馬英九政府更現風雨飄搖，行政院長毛治國請辭，堅不接受慰留，不願與馬英九政府同進退，內閣閣員更是情緒低落無心戀戰。
馬英九在民進黨勝選後立刻要多數黨組閣，即民進黨獲得立法院單獨過半席次，馬英九要禮讓由民進黨組閣，邀蔡英文進總統府共同研商，實是在馬英九的主導下和民進黨共同組閣，這是中華民國憲法上從未出現過的多數黨組閣，馬英九開創先河，要解決施政空窗期的危機。
以往總統大選在三月中舉行，總統於五月二十日就職，行之多年，但馬英九在他任內將大選提前與立委選舉合併於一月舉行，因之到五二○就職，有整整四個月的時間，這期間也可造成憲政危機，若然有重大事故應由誰來負責？
今民進黨在立法院選舉大勝，蔡英文曾表示不會整碗端走，會不分黨派提拔精英，但如何處理仍依新任總統來定奪，馬英九應尊重下屆總統的組閣權，攪亂一池春水，且與憲法體制不符，有人質疑馬英九規避責任，提前拋出爛攤子交給下屆政府。
其實馬英九政府應展開政權交接準備，成為看守內閣，嚴守分際，而交接工作可依循過去兩次政黨輪替的相關經驗與法規，分為總統府、國安團隊及行政院的交接，國民黨稱要做一忠誠反對黨，不會像當年陳水扁般做手腳在總統府內大量銷毀文件迴避責任。
政黨政治是責任政治，由執政黨負完全責任，國民黨馬英九政府還未落幕，仍有不可迴避的責任。只是新總統未能上任，在空窗期擔心許多的變數，今民進黨不接招，對於馬英九提出的「國會多數黨組閣」不領情，新舊政府應設法解決這些問題，才能客觀建立憲政的常軌。