1 05-09年間，食環署員工平均請病假日數，超出整體公務員的平均請病假水平，2007年的請病假日更較整體公務員平均請病假水平高78.5%；審計署又就09年食環署轄下19個分區辦事處的病假作分析，發現總計6400名員工，共請病假65000日，平均每人10.16天病假，較同年食環署整體員工平均請病假水平的9.22日更高。
2 未能識別經常放取病假或離開工作崗位個案，09-10年未有向至少10宗病假高於水平的個案採取行動。
3 至少12宗持久病假個案，食環署未有按規定要求醫管局委派醫事委員會研究。
4 04年7月已引入電子假期系統，但至今僅25%員工使用，容易導致假期未被記錄。
5 近5%例假申請在假期開始後才提交，187宗更在假期開始後10日或以上提交；審計署又審查於2010年3月31日仍尚待處理的假期申請，發現有14份申請在提交逾20天仍未處理，當中更有4份申請提交了5年仍未處理。
6 23個假期檔案室中，有3個竟完全沒有核查假期記錄、6個在抽查的三個年度裏，有一或兩個年度無核查。但按指引，部門應每三個月核查一次電子假期系統內的紀錄。