03年7月2日 政府宣布不與胡紅玉續約，委任王見秋接任主席，任期由同年8月1日開始，任期3年。
03年7月17日 平機會宣布委任余仲賢為候任行動科總監，但在8月卻突然宣布解僱余仲賢，事件引起極大爭議。其後胡紅玉被揭在聘任余仲賢一事上，有違平機會的聘任程序。
王見秋涉收受機票辭職
03年10月底 王見秋被指收受富商提供機票未有申報，及在出掌平機會時，同時領取司法機構提供的退休金，享有雙重福利，引起爭議。王見秋於11月宣布辭職。
05年1月 鄧爾邦被揭在上任前已登報聘請月入逾3萬元的私人助理，事前毋須任何審批。
05年7月11日 鄧爾邦率10名平機會高層到北京訪問5天，只餘1名總監留港，被指行政混亂，令管理層真空。
05年12月10日 鄧爾邦被平機會內部人士指花費近千萬元裝修新辦公室。
07年4月 殘疾人士林健德4月向平機會投訴遭航空公司拒絕登機，但該會職員錯誤理解法例，以涉事航空公司非在港註冊為由而不受理。直至12月另一名殘疾人士羅偉祥亦有同樣遭遇，向平機會投訴後，該會才發現出錯，並將兩宗投訴一併調查。
鄧爾邦欲七萬元坐頭等
07年9月 鄧爾邦應邀到瑞典交流，並獲提供經濟客位連食宿套餐。惟鄧以與法律顧問同行為由，將套餐轉予法律顧問，自己欲以逾七萬元乘搭其他航空公司頭等機位。事件遭質疑後，鄧才以三萬多元改乘另一家航空公司的頭等機位。
07年12月20日 鄧爾邦被揭發頻頻外訪，但其參加的部分會議其實毋須由主席本人親自前往。
08年1月17日 被揭發公然收受健體中心利益，向平機會所有員工及員工家屬提供會籍優惠，被指難脫利益衝突之嫌。
08年1月25日 遭踢爆原擬以50萬元豪辦研討會，遭委員強烈反對後，才將開支勁削3成至37萬元。
08年1月26日 鄧爾邦被踢爆合約未滿即獲發一百六十萬元的部分約滿酬金。
為員工訂造一年有薪假
08年10月3日 平機會人員醞釀為資深員工度身訂造最長可達一年的有薪「額外延長休假計劃」，但事件曝光後被平機會委員狠批構思會造成極重財政負擔，計劃才告胎死腹中。
08年10月5日 再被揭揮霍豪花公帑：花費三萬多元更換三十多張只用了半年的會議室座椅；將原本十五吋的液晶體顯示屏，更換為十九吋；添置近六十部打印機，幾乎每個員工都有一部；連空氣清新機也多達四十部。
08年10月30日 鄧爾邦的司機被指每月要申報達一百小時的超時補水。