不過，由於泛民主派一直辯稱「五區總辭」只是一種帶有公投意味的「真正」補選，特區政府如果不撥款進行補選，有機會違反《立法會條例》第三十六條有關立法會議席出現空缺時，選舉管理委員會必須安排補選的原則。泛民主派可以就此尋求司法覆核。

有人預期，無論特區政府是接納還是不接納建制派的修訂，泛民主派或建制派都會尋求司法覆核，法院亦會根據本地法律解釋有關是次「五區總辭」，結果必定是「五區總辭」屬於補選。

然則，法院的判決明顯與中央政府早前發出的嚴厲聲明相左，亦因為「五區總辭」的詮釋涉及「一國兩制」的主權問題，而主權問題只有中央政府才有詮釋權，中央政府就不可能對香港法院的判決差異坐視不理。由此可見，無論哪一方提出司法覆核，都不排除有人大釋法的可能性。

亦有人猜測，特區政府的打算，就是一方面同意撥款補選、安撫泛民主派的情緒，另一方面透過親中人士的力量，說服建制派不要尋求司法覆核。不過，要是建制派仍然堅持司法覆核，特區政府就敲不響如意算盤，更因為企在泛民一方，令其在中央政府心中的分數盡失，最後特區政府只會賠了夫人又折兵。