國民黨與馬英九出現了兩年來最大的政治危機，這不僅僅及於聲望，更影響及今後繼續執政之路。

痛定而思痛，馬英九說要以謙卑之心檢討，不過，他將敗選原因歸咎於大環境、參選人與政黨輔選等因素，隻字不提政策失當、「八八」風災救災不力等問題，引起諸多不滿。中央施政不能劍及履及，地方配合度不夠，與民間的期望落差太大，民怨由生。

過往國民黨執政時創造了亞洲四小龍的驕人成績，本來老百姓期望國民黨有諸多財經精英，一定可以挽救台灣的經濟；如今經濟沒有起色，加之在選前公布實施進口美國牛肉的衝擊，以及民生物品加價，令國民黨候選人壓力激增。

最重要的是，市民對馬英九投以不信任票。馬英九一如過往真摯誠懇清廉，但為何得不到信任與支持？主要在於馬英九當選後的許多作為都是朝「全民總統」方向邁進，他似乎視投給他的七百多萬票為理所當然，更在意的是沒有投他的五百多萬票，想把綠營選民扭轉為支持者，處處顧及綠營感受，政策宣示亦顧及綠營立場。但上任以來，他不僅沒有拉到綠營選票，反而得罪了基本盤，故這次支持者含淚不投票；馬英九也讓中間選民認為投藍投綠都一樣，不如選出較幹練的人選。

馬英九念茲在茲的是二○一二年競選總統連任，他必須重視這次警號，思考如何扭轉頹勢再創輝煌，並適時展現領袖的魄力，發揮政治智慧。