馬英九已展開他接掌國民黨的安排，中常會選舉結果顯示刻意淡化了功能，外界觀察就是要殺中常委之威風，讓中常委做不了事，以免國民黨以黨領政。過去國民黨的中常會乃決策機構，主導政府政策的走向，現被弱化架空，中常委成為聊備一格的點綴品。

吳伯雄曾揚言要裸退，抱着感恩的心情「無所求、無所爭」，現馬英九將吳伯雄升上榮譽黨主席之職，是基於馬英九既黨又政的身份，在目前階段不適合前往大陸參加國共論壇，未來兩岸事務將借重吳伯雄代表馬英九參加國共論壇。

馬英九此舉也在淡化國共平台的影響力，不讓國共平台以黨領政，吳伯雄的榮譽黨主席之職，亦與連戰並列，連戰不再是國民黨的至尊人物。同時今後兩位榮譽主席也將分工，吳伯雄管國共論壇，而連戰代表馬英九參與國際事務。可見馬英九的榮譽黨主席處理十分圓滿，今後不致有絕對權威超越黨主席馬英九之虞。吳伯雄對於馬繼續借重感性哽咽，馬英九權力收放之間取得了最好的效果，此初步布局已見成效。

馬英九接黨主席將提出改造國民黨的願景，不希望國民黨再被黑金派系綁架，走出健康發展之路。但近來立委的補選，這理想已受挫。國民黨長期的積弊實非一朝一夕能改變，馬英九亦將會提出黨產歸零的處理，不讓黨產問題成為每次選舉綠營攻擊的標的。

然而，今後選舉仍需重大經費，沒有了黨營事業，黨務費用甚至選舉費用支出將依募款所得，此實有不待，此即是馬英九現實與理想的衝突與拉鋸。