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日本豬流感攻陷學校，由中學生將疫情擴散，港府仍堅持社區一旦爆發豬流感疫情時，只幼稚園及小學全面停課；中學生「中招」，只局部關閉受影響中學。有中學團體直斥，港府至今仍未制訂明確的中學停課指引，令學界對停課安排意見分歧，有學校促請港府出現社區確診個案時，實施中小幼全面停課；有中學自訂校本停課指引「自救」。
食物及衞生局副局長梁卓偉昨回應日本疫情集中中學生時指出，兒童未必如成人般重視個人衞生，故較易受感染，若香港出現源頭不明的本地個案，幼稚園及小學率先停課；若中學生染豬流感，受影響中學會停課，至於其餘中學的處理方法，要按個別情況考慮。
學校訂應急措施自救
津貼中學議會主席廖亞全透露，政府未有明確制訂中學停課指引，部分中學因擔心停課影響教學進度而不贊成全面停課，各中學之間存在「兩難」處境。日本疫情在高中進一步散播，他認為，本港一旦出現社區爆發，政府應考慮中學實施全面停課，「香港人口太密集，一間中學都有居住九龍，甚至天水圍學生，所以一係全面停課，唔好分區停課」。
香港浸會大學附屬學校王錦輝中小學（中學部）自訂校本停課指引，一旦出現社區爆發、校內出現確診個案、或多名同學被列入疑似個案，校方會諮詢教育局及衞生防護中心的意見，決定停課。
沙田蘇浙公學校長陳漢齡亦指出，部分學生馬虎填寫健康申報表，或生病時沒有戴口罩回校，豬流感可能在校內傳播。英中聯會原訂七月安排約十名美國哈佛大學學生來港參加交流活動，若有人感染豬流感，活動將取消。
取錄大批日籍學生的協同國際學校，校長陳紹鉅表示，以往暑假都會舉辦為期一個月的遊學團，主要到美加、澳洲等地交流，今年見豬流感疫情嚴峻，校方決定取消所有遊學活動。
香港大學感染及傳染病中心總監何栢良表示，美加及日本等地，接連出現中學生集體爆發，相信與他們忽略個人衞生有關，「年輕人唔重視輕微病徵，好抗拒戴口罩同洗手，若染病後仲去補習或者參加聯校活動，會將豬流感四散」。他認為，港府需視乎情況採取全港停課措施，否則本港將步日本後塵，短期內出現疫情迅速爆發危機。