A股規定每手買賣單位為100股，連帶買入滬股通股票，同樣規定每手買盤均須以100股為交易單位，不接納碎股買入。不過，碎股賣出仍會被接納。
因此，在這機制下有可能出現一些特殊情況，就是完整買賣單位的買盤訂單，加上碎股賣盤合成的碎股交易情況。此時，上海證券交易所會把收到的完整買賣單位訂單與碎股訂單於同一平台交易，並以同一價位同行競價，與香港市場一般會將兩者分開不同價位交易的情況相異。
基於滬股通股票的每手買賣單位一律為100股，大家會發現不少以A+H形式上市的股份，A股的每手入場費會低於H股。這樣，對小額投資者來說，資金運用上就更為靈活。
相反，港股每手買賣單位不盡相同，一手10股、50股、100股、400股、1,000股、2,000股等應有盡有，上市公司更可選擇把買賣單位拆細，降低每手入場費，吸引更多散戶入場成為股東。