抗生素分為第一至四線，第一線抗生素用途最廣泛，能對付的細菌較多。醫生通常先處方第一線抗生素，如果療程後病人仍未康復，醫生會考慮開出藥效較強，副作用亦較多的二、三線抗生素；第四線抗生素主要是給癌症末期的病患。

不當使用抗生素會引發多種不良反應，如影響聽覺、損害肝臟等。