研究由中國外交部及日本外務省委託雙方學術機構，於○六年十二月開始進行研究，為兩國學者首次合作探討中日歷史上尚未達成共識的問題。

日認對華發動侵略戰爭

報告刊登了中日學者對於各時代歷史的研究論文。參與研究的中國社科院近代史研究所所長步平指出，雙方一致認為，南京大屠殺是一次反人道、殘暴的集體屠殺事件，並確認是日本對中國發動的侵略戰爭。

但據共同社報道，中方認為南京大屠殺死亡人數超過卅萬，而日方則認為最多廿萬，雙方意見不一；且日方的論文中亦無提及日軍進行細菌戰的「七三一部隊」。另外，在有主權爭議的釣魚島的歷史問題上，雙方學者仍有爭議。