有些評論把有問題非原廠藥的矛頭指向醫管局，但真正的源頭，應該是在衞生署。因為醫管局只是用家，當然採購的程序，醫管局也應遵守，但藥廠是否營運得宜、是否按規矩辦事，執法權力在衞生署。
現時被揭發的那一大堆問題，其實只是其中一部分，還有其他的問題正在排隊等候揭發。原因是整個行業的紀律廢弛，有法等於無法。當那些規條、要求、程序像是掛在牆壁上的裝飾品，當局不去檢舉執行，一些藥廠就不再當一回事。而政府招標一向是價低者得，所以營運模式一定趨向求量，一味大量中標、大量生產，犧牲的就只有質素。
非原廠藥的藥力較差，不只是其研發的時代較早，其生產者在生產過程中，也沒有大廠那樣精益求精，原料的純度可能沒有那麼高，儲存的環境可能沒有那麼好，而包裝合成可能也比較馬虎。非原廠藥的製作過程，也是影響療效的主要成因，一旦馬虎從事、品質把關不嚴，這些藥治不了病，反而成為禍端。
一些在投標失敗的藥廠無法求量，那就只能求變。把藥品商品化，按照一些私人執業醫生的要求，自行配製供應，這些藥不但未經註冊，事實上也不符合註冊的要求，例如濃度太高，一旦處理不善就會造成危險。但既然有買家提出要求，藥廠為了做生意，也就為一些醫生度身訂造藥品，這種行為實屬非法，在行內卻是時有所聞。
藥廠這樣明目張膽，因為看衞生署的編制，就知道有法等於無法，在利潤的誘使和競爭的壓力下，就只能走犧牲品質一途，經過一段時間之後，大家都習非成是，劣習也就大行其道。
歸根究柢，是衞生署責任大、編制小，管制藥廠更放到可有可無的程度，那就只能等問題惡化到自行爆炸才全部公諸於世！