市場對上海自貿區開放資本帳憧憬落空，但長遠而言仍屬中國改革大方向，城市大學經濟及金融系副教授李鉅威表示，自貿區開放資本帳可能會令部分金融交易，由香港回流上海，但認為不會因此影響香港的金融地位。銀行家則直言，單一開放自貿區的資本帳，很容易形成資金流失控的局面。
香港一直是中國與國際間資本流動的橋樑，自貿區若開放資本帳，勢將削弱香港優勢，李鉅威承認會對香港有衝擊，例如金融交易回流上海，但認為香港一直是開放的市場，即使其中一成金融市場交易，回流至自貿區，亦不擔心香港地位受影響，並指自貿區面對資金流出的風險大於資金流入。
銀行家稱，若准許自貿區與在岸市場的資金自由流通，自貿區將成為上海以至整個中國的資本帳缺口，所有離岸資金均會透過自貿區進入中國，容易形成失控；若完全將在岸和自貿區的資金分隔，自貿區則和其他離岸市場一樣，無突出的政策意義。
東方匯理高級策略師張淑嫻認為，上海自貿區是想在海外直接投資（FDI）以外，吸引更多外資直接進入中國，但直言要追蹤資本流動很困難。