感染甲型流感的女童為香港人，四月十三日在深圳出現發燒、咳嗽及抽搐，經診斷為上呼吸道感染及發熱抽筋，女童病情於本月十六日轉壞，同日返港入住瑪嘉烈醫院，前日再出現抽搐，已轉入兒童深切治療部接受治療，目前情況嚴重。女童的肺部X光檢查屬正常，臨床診斷為腦炎，其鼻咽分泌物樣本對甲型H1流感呈陽性反應。
衞生防護中心調查顯示，女童在內地期間並無接觸過家禽或雀鳥，最近亦沒有到過出現H7N9禽流感疫情的地區，她在深圳的母親及居於香港的外婆，亦曾出現上呼吸道感染病徵、喉嚨痛及感到發燒等，兩人均已痊愈，女童父親則沒有病徵。