60秒變「水棺材」
被撞「南丫IV號」在六十秒極速被海葬，眾多遇難者的證件和財物墮海，身份難以證實，當局除了出動千人展開海陸空搜救外，第一時間證實死難者的身份，成為營救行動的重中之重，希望在遺體送到殮房前可以初步確定死者身份，為此警方出動精英部門、「災難受害者辨認小組」（簡稱DVIU）共一百五十人次，更出動飛虎隊「水鬼隊」蛙人潛入船艙蒐證，搜索遺物和證件等，協助辯認身份。另外，為了方便調查，當局試圖將「南丫IV號」吊起，但一度失敗，因船頭鋼板折斷，令沉船再度「插海」，直至事後廿小時後，才由大型躉船吊起，同時撈起最後一名失蹤者的遺體。
須憑身上飾物辨認
由於「南丫IV號」船尾露天位「冇遮冇掩」，椅櫈亦非固定，事發時甲板頓變滑梯，不但椅櫈跣落海，乘客如玩滑梯一樣，沿甲板滑落海中。大浪冚至將不少人吞噬。船艙內的乘客不想成為亡魂，紛紛跳落海逃生。但有人走不及，困在艙內遭海水淹斃。警方「水鬼隊」聯同消防蛙人潛水通宵搜救，分別負責蒐證和搜索失蹤者，大批遺體送到香港仔水警基地，警方「災難受害者辨認小組」要憑死者身上的戒指及飾物等，協助辨認死者身份，再集體送往葵涌殮房，安排家屬辨認。該小組於八一年成立，隸屬刑事偵緝學校，正受訓的學員須學習如何在災難現場辨認死者身份，包括拍攝及記錄伏屍地點、處理死者財物及協助消防處調查事件起因等，出動時會穿上白色保護衣物、頭盔、口罩及紅色臂章以作識別。
該小組於九一年八月首次出動，協助辯認南中國海油輪海難中十八名罹難船員身份。同年，警方從英國引入「超級電腦」，及「重大事件調查及災難支援工作系統」(MIIDSS)，提高辨識災難死者身份效率；小組第二次出動為九六年嘉利大火，憑殘缺不全遺體辨認死者身份。○四年十二月底，小組亦曾到布吉海嘯災難現場協助核實，本港死難者身份及追查他們的下落，去年十一月底花園街大火，小組到現場候命。
兩大躉船吊起沉船
另一方面，昨晨三時半，一艘巨型躉船駛近「南丫IV號」，以威吔吊着露出水面的三分之一船頭，嘗試將其吊起，惟船頭鋼板突然折斷，令船再插回海中，期間有水警輪被沉船鐵錨擊中，兩水警受傷。至昨午四時，港燈派出兩艘大型躉船，成功將沉沒客船吊起，可見客船左邊船身及船尾明顯毀爛不堪，欄杆嚴重扭曲變形，其中一排四座位的櫈更被扯起，打直豎立於上層露天甲板上。消防小艇其後駛近船尾，隨即在海中尋獲最後一名墮海失蹤的女子遺體，整個搜救行動暫告一段落。