馬英九在出席中華民國和日本和約生效六十周年紀念活動，提出東海和平倡議：第一，不升高對立行動。第二，擱置爭議，不放棄對話溝通。第三，以和平方式處理爭端。第四，研訂東海行為準則。第五，合作開發東海資源。三禪感到，馬英九既向日本示好，又不願意和北京合作保釣和合作開發。
值得一提的是，六十年前，當時的中華民國政府獨自和日本簽訂二戰後和平條約，雖然確立台澎金馬以及西沙、東沙、中沙和南沙歸還中國，但當時也有撇開大陸甚至針對大陸的意味。六十年後的今天，馬英九特別慶祝這個和約生效六十年，也會令人覺得其討好日本，修補台灣對日關係。
事實上，在紀念活動中馬英九強調，他上任以來致力推動和日本的友好關係，並且已經把日本歸納為一個特殊的夥伴，也認為目前台灣和日本關係是四十年來最好的時候。不過，馬英九話鋒一轉，也對日本針對釣魚島動作頻頻感到相當憂心。他說目前台灣和日本關係是四十年來最好的時候，這是有違事實的。一九七二年，日本和北京才建立邦交，遂與台灣斷絕外交關係。台日斷交後的關係好過斷交前，馬英九這個邏輯是說不通的。
近期台灣和日本在處理釣魚島問題的摩擦、爭議升溫以來，馬英九被台灣監察院以及民間保釣人士認為不夠積極。因此，馬英九的東海和平倡議，有拉抬民望的意味。但是，要命的是，他對北京提出聯合保釣和聯合開發，一點也不回應。許多人都說，如果他有所表示，將對越南、菲律賓產生震懾作用。