台灣大選的議題觸及兩岸和平協議的簽訂，民間對此有疑慮，馬團隊馬上從這議題撤退，轉向攻擊民進黨提出的果農問題，可見兩岸的政治協商進程，仍有諸多困難尚待克服。維基解密透露了北京的官方態度，北京要求台灣進行政治協商，但是也理解馬英九還不能克服內部的困難。
馬英九在○八年競選時會見美國政府官員薄瑞光時表示，他若成為新任總統，將遵行陳水扁的「四不」訴求，並且執行五項行動：一、恢復與中共的對話；二、建立軍事互信機制；三、開創中國台灣共同市場；四、讓台灣以暫時協定的方式，加入國際組織；五、擴大台海兩岸的文化及教育交流。
馬英九○八年就職演說也表達希望與大陸進行政治談判與和平協定，但是過去幾年台灣情勢的改變，迫使馬英九不能太積極。大陸的態度仍是期盼可以「初步開啟」政治談判，只要保持對話的動力，放慢步調是可以接受的。
現兩岸只有深化經濟交流，就ＥＣＦＡ的項目擴大進行探討，讓經濟交流的層面更加廣泛，北京也認同此種做法。北京認為，加深經濟關係將無可避免地導向更加複雜的政治議題，這是無可迴避的，不過，北京與台北需要有共同的「政治信任」才能處理這些議題，大陸會致力於九二共識之下加強政治談判的基礎。
馬英九近接受美國傳媒的訪問，表示若連任，將不會赴大陸訪問會見胡錦濤，也不會談統一問題。現北京雖不推動政治談判，但由維基解密得知北京立場是經濟交流終必導致政治協商，現正值選舉期間，北京不給壓力，未來如何尚不得知。