往返屯門市中心與深圳灣口岸的B3X線為特快專線，惟繁忙時間經常爆滿，令中途站乘客無法登車。常於下午七時在屯門新墟街市站乘搭B3X線的陳先生指出，該線班次經常爆滿，且班次更延誤逾十分鐘，令乘客怨聲載道。陳發現同樣經過新墟站的B3線則有大量座位，惟不停新墟站，建議城巴B3線可於新墟站上客，方便乘客。
城巴發言人表示，現時B3X線及於屯門碼頭開出往深圳灣口岸的B3線，線路安排於○八年開始實施，於推行前已與運輸署及區議會商討，並獲署方及議會同意後才施行，暫無計劃調動路線。
就B3X線班次失準事宜，發言人指出，該線班次已大致能按照編定時間開出。
不過，屯門區區議員陳雲生認為，B3線較B3X線長途，惟客量則較B3X線為少，認為B3線線路安排有調整必要，將會於區議會會議上，與相關部門討論調整的可行性。