北區區議員盧佩珍表示,河套地區與附近區域道路接駁不足,根本未有道路連接至附近鄉村,河套區內學生宿舍亦不足夠。議員羅世恩則擔心河套發展未能增加北區居民就業機會,「好驚河套區係另一個科學園,對市民來講只係一個地盤,幫唔到就業。」議員侯金林則擔心深圳河污染影響區內發展,「條河咁臭,就算起咗濱河休憩區啲人都唔會過去。」
土木工程拓展署新界西及北拓展處總工程師廖振新回應指,深圳政府已處理深圳河污水,期望河水無色無臭,河套區內會建設學生宿舍,為一半學生提供住宿,河套區東面亦會興建新路接駁至古洞北新發展區,並改善西面的現有落馬洲路,有關教育用地用途仍在諮詢,未考慮如何分配。