蔡英文為民進黨披戰袍出戰新北市，動見觀瞻，近期她出席獨派活動，表示中華民國是「流亡政府」。其實，經過幾十年變遷，國民黨已透過合法程序成立民主政府，落地生根。故就事實而論，提出中華民國是「流亡政府」，是欠缺理論與正當性的。蔡英文作為民進黨黨魁，應為不當言論負起全部責任，這也令藍營追擊：難道小英的思想比阿扁還獨？
民進黨在執政八年後被民意拋棄，能在廢墟中站立起來，憑的是與陳水扁切割，在蔡英文領導下的理性中間路線獲得認同。經過歷史驗證，民進黨已無走回台獨路線的本錢，更不可能採取過去阿扁時代封疆鎖島、拒絕與大陸來往的政策。如果蔡英文今後要帶領台灣走上比阿扁更獨的路線，民進黨在台灣現今的土壤就很難再開花結果，因為在兩岸的氣候上，北京不會讓台獨有發展空間。
在民進黨的領導層中，過往均是本土或鄉土味極重的代表性人物，陳水扁的本土意識，讓他用土法煉鋼方式炮製台獨的訴求，雖然獲得深綠台獨人士的擁戴，但台獨在他任內並無法達成，只得表示「台獨做不到就是做不到，李登輝做不到，我做不到」，向現實低頭，知道台獨圖騰徒費心力。
蔡英文乃留英的法學博士，有國際視野，她應該對台獨是一條行不通的路有所認知。在現今兩岸交流獲利的驗證下，要走台獨之路只會被選民拋棄，她的「流亡政府論」乃是為了選舉討好深綠，但亦激起了極大的反彈。
蔡英文為新北市的候選人，這有近四百萬選民的地區，是總統大選的重要據點，泛藍憂心之餘，抓住「流亡政府論」作為對綠營、對蔡英文主要的攻擊點，就像當年馬英九曾說「終極統一」般被綠營抓住不放，都是選舉操作。