賀爾蒙補充治療有助改善更年期不適的徵狀以及預防骨質疏鬆症，所提供的是雌激素。另外，醫生亦會處方黃體酮，用作預防與降低雌激素所引起的子宮內膜組織增生。部分女性如已因其他原因而切除子宮，則不需額外服用黃體酮。雌激素和孕激素綜合治療一般可分為兩類：
（一）周期性綜合治療——適用於停經前後而欲保留來經這女性特徵的婦女。當中的雌激素持續每日服用，孕激素每周期（28日）用10至14天。這種服用激素形式能令服用者維持每四星期便會有一次月經。
（二）連續性綜合治療——適用於不欲來經的停經女性。當中的雌激素和孕激素要每日服用，劑量比周期性的為低。這種服用形式可使服用者不會再有月經。在開始採用這種連續性綜合治療的最初四至六個月，陰道有可能出現不規則的經血。
賀爾蒙補充劑也有一定的副作用。有研究指出，服用者患上靜脈栓塞、乳癌及子宮內膜癌的機會較高，所以醫生一般不建議曾患這類疾病或有相關家族病史的人士服用。另外，患有心臟疾病、中風、肝病或陰道無故出血的人士亦不適合使用。對於患有腎病、癲癇症、偏頭痛或糖尿病的人，亦需慎用此類藥物。
總括而言，不是所有更年期的女性都需要或適合服用這類藥，服用與否需經由醫生作詳細身體檢查，及進行包括病情及風險的評估，然後再作決定。服藥期間亦應定期覆診作跟進，這樣便可更安心。
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