應付重大自然災害，軍隊擁有現成的組織力、機動力及資訊力。與天地鬥爭近似作戰，做過後備役海軍中校的馬英九完全明白。因為沒有第一時間發布緊急命令，動員軍隊抗風救災，「台灣國家聯盟」痛斥馬政府是怕得罪中國大陸。

曾參加「九二一」震災救援的退役將領認為，總統早該頒布緊急命令，讓軍方全面接管災區。正因台灣政局不穩定，執政黨稍有差池便遭政敵搏擊，動輒危及國本。調兵事關重大，馬英九在未全面掌握災情前不敢貿然動兵，否則給政敵借題發揮，賠了夫人又折兵。

馬英九在「國安會議」指示台軍要加派一萬兵力救災，國防部長陳肇敏遵令使軍隊維持最低戰備，其餘全力投入救災。由於各災區空域容積量及管制量已達飽和，為確保直升機於災區活動安全，空軍司令部制訂航空器進、出航飛行規則，防止事故發生。

截至十五日，官方證實風災死亡人數為一百二十四人、五十六人失蹤，比汶川大地震的破壞力小得多，但台灣當局已經手忙腳亂，顯示民主政制的應變能力確實不如權力高度集中的社會，也印證了《韓國綜合國力》的分析結果：一黨獨裁體制的中國的政治實力竟是世界第一。