恐怖主義組織阿蓋德的前身便在此時成立，策動及融資者之一是沙特富商拉登。這組織全球招攬「聖戰戰士」送往阿富汗境內或巴基斯坦邊境地區的訓練營，接受游擊戰及恐怖襲擊訓練。美國否認曾與拉登合作，但承認在蘇阿戰爭期間，透過巴基斯坦國家情報機構經濟資助「聖戰戰士」。換句話說，美國可能沒有叫拉登辦恐怖分子訓練學校，但卻為入讀的學生交學費，畢業後只要他們襲擊敵方，便給他們出糧。

拉登與美國關係惡化，始於伊拉克入侵科威特，威脅沙特阿拉伯安全。拉登請纓發動聖戰，沙特皇室不領情，反而邀請美國出兵襄助。拉登認為，讓異教軍隊進駐麥加及麥地那這兩個伊斯蘭聖城所在土地，是離經叛道，矢言把美國人及其代理人從神聖土地上趕走。

中國指「東突伊斯蘭運動」與阿蓋德有關，美國一直聽而不聞，反指中國鎮壓境內少數民族。但二○○一年「九一一」事件之後，美國突然改變立場，把「東突」列為恐怖主義組織，並凍結其在美資產。有論者認為，美國轉軚是因為布殊政府有求於中國，包括減少向美國敵對陣營輸出導彈技術，及不要在聯合國安全理事會否決針對伊拉克的議案；二○○二年十月，更成功邀請當時的中國國家主席江澤民，到布殊的德州牧場作客。

美國是「反」恐抑或是「撐」恐，請看官自行判斷。