馬英九與王金平於二○○五年競選黨主席，馬將王打為黑金之代表，結果馬高票勝出，但重創了與王金平的情誼，「馬王心結」由是而生，在馬政府執政一年此心結仍難以彌平，在蕭瑟處總見傷情的分歧，不經意的流露，以致眼神總無交集。馬上任之初，提名偏綠的考試院長及監察院副院長，卻在立法院被打了回票，於是，政壇都深深揣測是否「馬王心結」的具體表徵。

然自馬英九志在必行地表態要兼任黨主席時，國民黨內的權位之分起了茶杯裏的風波，甚至被稱為宮廷內鬥。但王金平自始至終一直平和以待、樂觀其成，王金平甚而表態說：「所謂馬王心結已成過去，未來我和馬總統會和諧團結，求最大進步。」王金平的表白讓馬英九寬心，「和諧團結」是國民黨進行的現在式與未來式，馬王兩人已是一笑泯恩仇！

王金平是立法院內十連霸的元老，他在中南部有雄厚的民意基礎，在立法院內溝通藍綠成為共主，在台灣政治對立的生態中，王的表現與成績實是異數，他是有雄厚實力的本土派大老，今馬英九問鼎黨主席逼退了吳伯雄，必須對本土派安撫，王金平實是最好的棋子。

王金平政治幹練，深知馬今後黨政大權在握，只有與之為善才能分享權力，王今後在立法院的不分區席位乃靠馬英九提名，權力來源在於馬的一念間，因之馬王合作才能互利雙贏，當然馬英九也必須有分權共治的胸懷與氣魄。

由於馬英九表示，他今後未必參加「國共論壇」，倘若馬提名王金平為第一副主席，以其本省人的背景，加之馬英九過去曾說國民黨不排除獨立的選項，馬重用王參與「國共論壇」，乃與啟用綠營賴幸媛為陸委會主委有異曲同工之效！