但兼任黨主席，馬英九在兩岸議題上走上第一線，失去了迴旋的空間，兩岸間也少了潤滑劑，更何況會削弱國共平台的作用。五月間吳伯雄與胡錦濤會面時就強調「國共論壇」不能廢，確定兩黨領導人定期會面的機制，但馬英九接任黨主席之後，在現今台灣的政治環境下，是不可能跨海而去會見胡錦濤，國共領導人不能會見，國共平台自然就會降低了規格與影響力。

馬英九接任黨主席其實是表明國共主導兩岸事務的情勢已經退去，馬英九政府也強調回歸政府體制的海基、海協兩會運作才是第一軌道，今後國共平台會退居二線，成為第二軌道，僅發揮輔政的功效，換言之，國共平台已完成了階段性之任務。

兩岸間的互動乃先經濟後政治，先易後難，馬英九執政一年來已收割了兩岸互動國共平台釋放的諸多利多成果，現兩岸經濟政策已全面開放，從兩岸三通到陸資赴台等，兩岸的經濟融合讓台灣經濟復甦終見成效。馬英九是高票當選的總統，當然不能處於被動之地位，因之他要收回國共平台的主導權，同時也可回應綠營人士對開放兩岸政策之疑慮與憂心，馬英九接任黨主席，對國共平台推動下的快速前進速度能有所煞車。

事實看來，馬英九兼任黨主席後，將以掌控國民黨的資源爭取連任，屆時國共平台就不可能喧賓奪主脫離馬英九的規範，此乃精義所在。