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臨近小五呈分試作升中派位，以及全港性系統評估，各學校無不擔憂豬流感擴散而要停課。有小學校長心理準備五成機會突然停課，已做好多重措施應變。教育當局如遇小學及幼稚園停課太久，最壞打算會被迫取消全港性系統評估，並延遲舉行小五呈分試。另外，不少私立獨立幼稚園校長則擔心，將會重現沙士時期提早退學或拒交學費潮，加上港府欠缺支援，令幼稚園經營更加困難。
食物及衞生局局長周一嶽昨聯同教育局常任秘書長黃鴻超，與中小學校長開會商討豬流感應變措施。黃鴻超表示，當局會與學校緊密聯繫，昨亦向學校簡介預防豬流感措施，讓學校做足準備。
教材上網 老師拍片授課
香港資助小學校長會主席張志鴻會後表示，一旦停課，家長普遍擔心「趕唔切」教學及影響考試，但他強調學校會有兩手準備，包括將教材上網、透過校園電視台及由教師拍攝教學短片，讓學生於家中學習。「停課對學生的影響一定會有，但不會縮短暑假的時間。」
張志鴻引述當局在會上表示，一旦停課時段與小五呈分試、畢業試等重疊，有關考試將會順延；但原定於六月舉行的全港性系統評估筆試則或因停課太久而取消。
此外，博愛醫院歷屆總理聯誼會梁省德學校校長陳志雄亦稱，若疫情嚴重，導致學校需停課至七月中旬就會考慮提早放暑假。校方已準備因停課而取消考試，改以進展性評估，並將功課上載至學校網頁，或透過速遞將功課放進學生住所的信箱，老師會以電話個別教導學生做功課。
「只能用僅餘儲備應急」
至於幼稚園方面，大埔區學前教育園長會主席郭楚翹表示，停課嚴重影響私立獨立幼稚園，因學費為該類學校主要收入來源，一旦停課兩周甚至四周，將有個別學童家長因沒有上課而拒絕繳交學費，但學校仍需向老師支薪，她慨嘆：「私立獨立幼稚園遇上停課或家長拒交學費，只能動用僅餘嘅儲備應急！」
香港幼稚園協會會長唐少勳亦擔心，沙士時期一度出現的提早退學潮或拒交學費潮將會重臨。她又指學費為全年性的費用，只是家長斬件式繳付，故惟有寄望學童家長按時繳交學費。