○三年沙士在香港肆虐，全城陷入恐慌，為改善環境衞生，當時仍是政務司司長的曾蔭權被委以「清潔大隊長」之職，統領全城清潔策劃小組，負責研究及制訂一系列嚴厲措施，提升市民的清潔意識。但全城清潔工作兩年後已後繼無力，審計署曾批評全城清潔計劃虎頭蛇尾，工作成效參差。
多部門工作欠佳
全城清潔策劃小組職責包括為清潔香港訂下長、短期措施，耗資十五億元以扭轉當時國際認為本港是高危地區的印象。但審計署在○五年發表報告指，推行全城清潔的政府部門工作欠成效，民政事務總署欠缺足夠義工翻看黑點電視錄影帶、食環署沒有掌握閉路電視拍攝到的違例時間採取行動、房屋署兩年來仍未展開首輪屋邨渠務檢查等。
衞生黑點無改善
有團體再於○六年巡視全港二百多個衞生黑點，發現八成三的黑點情況仍然惡劣，即使部分全城清潔策劃小組聲稱已清理的衞生黑點亦有「死灰復燃」之勢。團體狠批全城清潔策劃小組只有三分鐘熱度，促請政府加強執法。