被視為台灣總統選舉前哨戰的五都選舉降下帷幕，國民黨成功保住三都，沒出現有人在選前預言的五都盡墨局面，但總得票數卻比民進黨少四十萬票，只能算是險勝。
今次選舉結果表明，藍綠雙方力量此消彼長。民進黨在台南、高雄取得壓倒性勝利，反觀國民黨，除台北市郝龍斌以較大比數勝出外，其餘兩都戰績差強人意。贏得最險的是大台中市，胡志強僅比民進黨對手多三萬餘票，令人大跌眼鏡。難怪有人說，若非選前之夜發生連勝文被槍擊一案，激發藍營支持者的投票意欲，國民黨可能連三都都保不住。
國民黨的成績單向競逐連任的馬英九發出了強烈警示。想當日，馬英九以七百多萬票的絕對優勢奪取總統寶座，但此情此景已成明日黃花。國民黨這次在五都的得票數比總統選舉少了一百二十萬票，而國民黨在去年縣市長選舉中的得票數也比總統選舉時少了一百萬票。這就是說，馬英九執政兩年已流失了二百多萬票。
值得注意的是，這次藍營失利並非統獨之爭的結果。民進黨在選戰中一反常態，沒有挑動族群矛盾，很少觸及統獨議題，連ＥＣＦＡ問題也予以迴避，而是專攻國民黨政府的施政。實際上，馬英九上台以來施政漏洞不少，內政乏善可陳，「八八」水災、進口美國牛肉等爭議都令政府支持度大跌，加上金融海嘯，馬英九疲於奔命，所以在選戰中，施政成了軟肋，被對手揪住來打，也讓藍營處處陷於被動。
本來，馬政府最引以為榮的政績是改善兩岸關係，尤其是簽訂了ＥＣＦＡ，但這些政策尚需時日才能惠及基層民眾，未能反映在選票上。而馬政府為了討好本土選民，不敢理直氣壯地宣揚其兩岸政策，連「一中各表」都閃爍其辭，但綠營的選民根本不領情，這次綠營在南部大勝，宣布討好本土策略破產。
五都選舉可說是台灣的中期選舉，在世界各地，中期選舉都是對執政黨的嚴峻考驗，在野黨必然抓住其施政漏洞大加鞭撻，執政黨處處被動捱打。美國不久前舉行中期選舉，奧巴馬的執政陣營一敗塗地，連眾議院控制權都丟失了。
反觀台灣，馬英九的命運比奧巴馬稍為好些，能在中期選舉險勝，黨內再沒人會挑戰他競逐連任的資格，他已獲得二○一二年大選的入場券。然而，馬英九必須清醒地看到，他未來的對手已不是那個被阿扁腐敗案弄得千瘡百孔的民進黨。民進黨透過五都選舉已重獲生機，尤其是黨主席蔡英文，在新北市市長選舉高票落選，氣勢如虹，將成為馬英九連任的最大障礙。馬英九若掉以輕心，不努力改善施政，理直氣壯推動兩岸關係，台灣難保藍天不變色。