沖繩人經歷二戰與美軍慘烈一役，戰後又承受駐當地美軍基地滋擾，本以為鳩山競選承諾會為他們帶來安寧，不料他根本無力逃出美國的「保護」。政治評論家小林吉彌指普天間問題亂得離譜，沖繩縣副知事上原良幸指鳩山政府解決問題手法幼稚，普天間問題終結了這個政府。沖繩縣邊野古灣六十八歲居民森山憲一痛斥：「鳩山未有充分理解沖繩人因美軍基地而受的痛苦！」
鳩山內閣雖短命，但已衝擊日美關係。鳩山昨辭職時稱：「我不信日本在未來五十至一百年仍需靠美國防衞。」而日本外務省在美國進行的最新民調顯示，五成六美國受訪者認為美國在亞洲最重要夥伴是中國，只有三成六認為是日本，是日本廿五年來首次降為第二。