本文重點
法國航空已確定客機失事的位置，但出事的真正原因目前仍然是一個謎。對於早前有指客機遭雷電擊中，專家指可能性不大，因飛行正常高度都在放電雲層之上。法航則指客機失事前出現多個技術故障，可能是出事起因，外界則眾說紛紜，以下有三大揣測：
客機被雷擊中
1963年一架泛美航空客機被雷擊中爆炸墜毀，八十三人死亡，有人認為法航客機遇上同樣命運，但有航空專家指現今的客機被雷擊而墜毀的機會不大，因為雷達會協助機師避開不穩定的雷雨雲，即使在二萬呎以下亦很少出現機身被雷擊打破的情況，而且機身備有避雷裝置，一旦遇雷擊，可把電引導到大氣中（見圖解）。
受強勁氣流干擾
氣流是一種普遍現象，正常情況下看不見，而且屬突然的空氣活動。氣流可能因氣壓變化、噴射氣流、山峰引起的波動、冷暖鋒及大雷雨而發生，但有專家指這非造成致命性飛機失事的原因。
電力系統過於複雜精密
有分析指客機的機種A330有多套備用電力系統，可確保有無線電發出求救訊號，但由於太過精密，一旦遇險，操控難度極大。一名曾駕駛A330的駕駛員指肇事客機機師當時可能忙着操作，無法分心求救。去年十月澳航一架A330曾出現電力故障，導致其中一個電腦故障，造成逾一百人受傷。