國民黨明年舉行黨主席選舉，黨內各種雜音經已挑戰馬英九的威權，黨籍立委蔡正元公然提出馬已連做兩任，不能再選黨主席，此顆震撼彈讓黨內的不滿情緒一下子炸開了。
蔡正元發文指出根據人民團體法對政治團體的規範，現任黨主席馬英九算是連做兩任，所以不能再選黨主席，就算馬當選也會被法院依前有的判決案例宣告當選無效。
過去黨內的中青代的確蠢蠢欲動，欲爭黨主席之位，但經黨內勸退，而一片尊馬之聲。馬英九現正處於弱勢，民調跌落百分之十三，遭內外夾攻，外有民進黨的「罷馬」，內有要求馬專心國政勿兼黨魁的呼聲，不過改變不了馬英九的決心，頻頻下基層與地方黨工溝通，志在必得之勢，置黨內紛擾於一旁。
馬英九為何堅決競選到底，和他一向溫良恭儉讓的作風迥異，因這屆的黨主席將關乎二○一四年七合一選舉和一六年立委選舉的提名，甚至關乎下屆總統大選的提名，馬英九於此氣勢極弱之時必須掌提名兵符，以免進入後馬時代諸侯強起取代君王。
國民黨中央也依承意旨做出解釋，認為馬連任黨主席可「黨政密合，以黨領政」，要做好施政必須兼任黨主席。馬自擔任黨主席後積極改革黨務，引起基層黨工的反彈，且弱化中常會的功能，黨產問題也遲遲未解決，因之黨內要求馬英九應專心國政。
國民黨中央強調要鞏固黨政合作，可有效達致執政目標，明年七合一選舉若失敗，黨內反馬英九勢力必逼他下台以示負責。馬英九現遭內憂外患，主要都是因施政太不濟，民怨四起，失去了威信，無法服眾，予人嗆馬可趁之機。因應否連任黨主席各具其理，惟黨內的紛爭亦將影響社會觀感。