新政府總部除了成為走光黑點外，在大樓興建期間亦事故頻頻，無論設計及安排都備受批評。學者炮轟此乃政府好大喜功之故，為了盡快啟用新總部，導致設計及安排失誤。
新總部啟用後，示威區又被議員狠批「唔足尺」，而且只會於周日開放，平日市民被迫於行人路請願，被指有意阻撓市民表達意見。
另一方面，亦有指新總部範圍內的手提電話訊號十分微弱，儼如與外界隔絕通訊。
城市大學專業進修學院學術統籌宋立功狠批曾蔭權為了「攞彩」，在任內盡快進駐新政府總部，故此在設計及安排上欠缺周詳考慮，「政府想喺副總理面前風風光光，個特首又想喺任內搬到入去攞彩，咪搞到甩甩漏漏！」他促請政府盡快進行檢討及改善安排。