解決香港深層次矛盾是一項複雜的社會系統工程，決不能「頭痛醫頭，腳痛醫腳」，不能東放一槍，西放一槍，更不能設想「畢其功於一役」。

所謂「深層次矛盾」，其形成必定有深刻的歷史根源、社會根源，有結構性缺陷。就以人心尚未完全回歸而言，之所以成為首要的深層次矛盾，是因為：

第一，英國對香港一百五十多年的殖民統治，造成香港對祖國的疏離感；第二，中共建政後前三十年「以階級鬥爭為綱」導致的三次「逃港潮」，偷渡客及其後代對內地政治氛圍仍心有餘悸；第三，港英政府在過渡期的「民主拒共」部署對港人心態的影響，其培養、扶植的政治勢力（包括在輿論界、法律界、教育界的隊伍）盤根錯節；第四，外部勢力的干預令「樹欲靜而風不止」。

正因為有以上的「因」，才有在地區直選中反對派囊括近六成選票的「果」；以致回歸十二年，「愛國者治港」仍可望不可即，港人的國家意識，對香港法律地位的認識，以及對《基本法》憲制地位的認識等實有待加強和提高。而這些觀念形態的轉變，只能靠公民教育、靠擺事實、說道理、靠國家本身的進步來解決，是急不來的。