這三個擔憂的核心問題，是第二個擔憂，即「台獨」會否捲土重來。「台獨」若捲土重來，現在馬英九政府的兩岸政策肯定會變；外力干預也必會令台灣當局的政策搖擺不定——擺向破壞兩岸關係和平發展、頑固拒統方面。

馬英九的兩岸政策是「不統、不獨、不武」。馬英九只是「不獨」，從來沒有認真反「台獨」，還曾經把「台獨」當成一個選項，他不會也不敢認真反「台獨」，原因有二：一是他對「台獨」未必有多大的反感，他對「統一」的畏懼和反感可能還超過「台獨」；二是他明白在台灣社會的現狀下若貿然反「台獨」，就會被扣上「統」帽子、「紅」帽子，甚至「賣台」帽子，就會大失選票。

這第二個原因，是最嚴重的問題。它不是馬英九個人的事，甚至不是國民黨的事，而是台灣的社會政治問題，因此，也是北京最為擔心的事情。問題的棘手還在於：第一，它的不確定性很強，誰也不清楚「台獨」的力量在每一次「選舉」中能起多大的作用；第二，北京隔海反「台獨」，輕了不起作用，重了在台灣社會有反效果。

不排除「台獨」捲土重來，是因為北京也知道台灣是一個民主選舉執政黨的社會，而且「台獨」勢力這些年在台灣已經扎根，有相當的社會基礎，有一定的基本盤。「台獨」勢力能否捲土重來，基本上取決於重拾「九二共識」的國民黨的執政狀況是否令台灣選民滿意，對此，一年多以來，馬英九表現麻麻，民望一直插水，北京看在眼裏，憂在心頭。