馬英九上台後推動的兩岸政策，大方向是對的，只是馬英九急於兌現「馬上就好」的承諾，快速地開放兩岸政策，開放的步伐速度在台灣內部有承受能力的質疑，快速擁抱中國令綠營人士有危機感，恐損及台灣主權，淪為香港第二。因之馬英九攘外必先安內，先與在野黨取得進一步的溝通，廣開言路，才能讓開放步伐穩步向前。
在馬英九政府執政滿周年，有民調顯示近四成民眾不滿意馬英九執政團隊一年的表現，百分之五十的民眾擔心損害台灣主權，近六成民眾希望內閣改組。台灣民眾的心情是複雜的，對馬英九有超過五成滿意度，但一年來對馬英九的不滿意度由百分之十升到三成三，這也是一個警訊，馬英九及其團隊仍須努力。
馬英九的清廉形象獲得選民支持，但是他上台以來對於肅貪執行不力，不符民眾的期待。如軍購弊案及軍中的買官案，國防部查辦效果不彰；陳水扁的貪腐弊案辦得拖拖拉拉，半年多來還未能結案，傳一大堆涉案人卻無下文，讓民進黨有了伸張司法人權的藉口，授人以柄，而有關金改及財團仍投鼠忌器。民眾期待馬英九能雷厲風行，除貪腐弊案外，還有「三一九」槍擊案等勿流入歷史的沉箱中。
在官員民調中掛車尾的乃是國防部長陳肇敏。他原是綠營人馬，馬英九又重用之，他曾於立法院說沙士是中共的細菌戰引來軒然大波。馬英九為了當「全民總統」而刻意討好綠營，綠營人馬和綠色思維仍處處存在於政府中。在民進黨執政年代，因支持國民黨泛藍而備受打壓杯葛的人士和社團，至今仍一樣地遭受打壓，馬英九希望在藍綠通吃下獲得優勢，此也助長了一些討好綠營者的氣勢。
民意如流水，台灣的政治現況藍綠仍存在根深柢固的歧見，在掌聲響起之際，馬英九政府應更警惕，若只顧討好綠營，政策很可能失去了方向。