早產嬰兒多個器官未發育完全，部分醫生會建議這類嬰兒減少預防接種，避免他們接種後出現更大的副作用，但德國維爾茨堡大學調查發現，只有兩成早產嬰兒接種後出現發燒和睡眠不好等不良反應，同類副作用在足月嬰兒也會出現，故毋須擔心接種預防疫苗影響早產嬰兒健康。

專家對德國二百一十六名出生時體重不足一點五公斤的早產嬰兒進行研究，發現接種預防疫苗明顯提高他們抗病的能力，一些醫生擔心的預防疫苗對早產嬰兒身上產生心跳過慢的嚴重副作用問題也很少出現。

這項研究顯示，一些醫生對早產嬰兒接種疫苗影響嬰兒健康的憂慮缺乏科學根據。德國社會兒科學及青少年保健協會認為，早產嬰兒特別容易感染百日咳等嚴重疾病，故他們應按時接種預防疫苗。