一九八九年東京新宿區進行一項建築工程時發現大批人骨，骸骨有鋸痕，一些頭骨有鑽洞，有些人骨被割去一部分，估計死者多達一百人，大部分是日本人以外的亞洲人。地盤附近在二次大戰時用作軍醫學校相關設施，學校設七三一部隊防疫研究室。

民間團體懷疑骸骨可能屬於人體實驗的受害人，不過厚生勞動省在○一年指出，人骨極可能是校內的人體標本，與七三一部隊關係不詳，人骨此後一直被保存。

但在○六年，校內一名前護士向厚生勞動省表示，日本戰敗後，她與同事被命令在數個地點埋葬屍體、人骨及人體標本。當局因此決定在她所指的亂葬崗位置進行挖掘和調查。