監察團體憂香港段或通車不成

根據去年二月立法會工務小組委員會的文件，高鐵香港段將直達廣東省內四個短途站及全國十六個城市的長途站，但這些車站均無常設清關設施，內地難以在香港段直達的各短、長途站以至更多城市，一一設立口岸進行「兩地兩檢」。

文件並指，若實施「兩地兩檢」，由於乘客在車廂內尚未辦理目的地的出入境清關手續，故必須進行封閉式管理，分隔由香港出發與內地段出發的乘客，以致列車內「香港乘客區」及「內地乘客區」的座位不能最有效地被使用，不利營運效益，而為分隔跨境和內地乘客，內地段車站的站台和通道管理亦會非常複雜，削弱高鐵效益。

內地無可能每站設邊檢

王國興指，西九總站興建時已預留位置一地兩檢，若不能實施會令香港段變得無意義，而內地高鐵車站眾多，無可能逐一設置邊檢設施，憂慮無一地兩檢，香港段有機會不能通車，復損失以百億元計的經濟效益，他認為一地兩檢是最好安排，絕對支持。

香港運輸研究學會資深會員熊永達則認為，無一地兩檢不至於不能通車，但最惡劣情況是在進入內地首站設口岸清關，他不希望此狀況出現。城市大學專業持續進修學院學術統籌宋立功指出，兩地兩檢會令香港段淪為西九至深圳的直通車，無法達至高鐵原意。