兒童嬰兒無法過關
熟悉出入境運作的人均知道，並非所有港人都可以使用e道，如十一歲以下兒童，他們仍在成長，指模或樣貌不斷變化，故要沿用傳統櫃位。若高鐵採用e道，日後一家大細乘搭高鐵，手抱嬰兒將如何過關，將成為一大難題。
需執法人員「睇實」
另外，即使現有出入境e道，也要有執法人員在旁「睇實」，如有人過不到閘，可能是證件或技術問題，亦可能是通緝犯，此時入境人員即會現身，違法的就帶走，純因閘機故障就放行。
換言之，始終都要有內地人員執法把關。故有港府中人直言高鐵「一地兩檢」同政改問題一樣，走進「死胡同」，若工程不斷拖延，隨時又要留待下屆政府處理！