傳統中藥複方藥理研究一般是基於中藥方劑的功能、主治等中醫藥理論指引，通過驗證發現其藥理作用，闡明機制。中藥方劑主要分為傳統古方和現代經驗方，經驗方的研究往往探討臨床有效性的機制，着重藥效及安全性，以形成有效、低毒性並適合工業化生產的製劑；古方研究則多探討方劑的作用機制，為方劑的傳統功效描述，賦予現代藥理學內容。
中藥複方的藥理研究方法主要有四類：一是傳統方法，研究複方時採用傳統的水煎口服方法，或經初步提取的粗製劑。藥效評價也從整體試驗發展到器官組織、細胞、分子生物學及系統調控等四項水準；二是基因表達的調控研究，不少研究都涉及免疫調節、抗腫瘤、延緩衰老、神經系統、內分泌系統調控等領域；三是從過去的單一指標向多指標發展，例如小半夏加茯苓湯的藥理試驗證明，它能抑制嘔吐中樞的敏感性和保護胃黏膜，從而止吐，體現多水準、多指標綜合的特點；四是中西醫結合研究，中藥複方是在中醫病機、藥性理論指導下的有機配合，中醫治病以「證」為對象，許多研究者考慮到方證結合，多在現代藥理藥效學及其機制研究的基礎上，引入中醫證病理模型。方證結合促進了中西醫結合的研究工作，方劑的藥理學研究為中醫證病理模型的創立提供了思路。
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香港大學李嘉誠醫學院中醫藥學院副教授 張艷波博士