高鐵延誤引起各界關注，立法會議員質疑若高鐵工程延誤，延遲交還西九區內臨時工地，令西九工程也要被迫推遲，致使西九超支，政府、港鐵或西九管理局，應由哪方承擔費用。當局提交立法會監察西九聯合小組委員會的文件稱，西九區內的高鐵工地，由地政總署批予路政署，由港鐵施工，路政署會在高鐵完成後，以漸進方式交還予地政總署。
移交日期無合約協議
當局指出，港鐵與西九之間，就工地移交日期並沒有合約協議。因此，西九管理局並沒有權利因港鐵延遲交還工地引致的損失向港鐵索償。
文件又披露西九管理局十名高層管理人員的薪酬，在二○一三至一四年度合共達二千八百多萬元，當中行政總裁連納智的薪酬為六百三十九萬元。