兩岸好不容易地克服歧見簽訂了服務貿易協議，未料在簽定後引起了業界的軒然大波，因服貿協議而得利者悶聲不語，因服貿協議而受影響的業界吵翻了天。馬政府事先的溝通不周引發的負面效應可謂不小，馬英九也親上火線到南部去溝通解說，為何馬政府的德政遭反彈，問題一再重演。
兩岸的服務貿易協議牽涉大陸的台商，國台辦先向台商甚至來港和台商們說明，取得台商們的理解，馬政府卻認為為掌談判主動權，內容乃天機不可洩露，因之事後的反彈聲浪實難以招架。
服務貿易協議須送立法院備查後才能實施，但是代表業界的立法委員起來發難，尤其民進黨主張逐條表決，不適宜的條文就應刪除，但國際條約之規範是簽訂後不可再刪改，否則失效。此服貿協議卡在立法院難以放行，國民黨立委亦有業界的壓力不完全配合，讓立院黨團倍覺無奈。
過去兩岸經貿合作初啟動時，台灣社會有「既期待又怕受傷害」的心理，大陸對台讓利，做出對台傾斜的安排，今兩岸的經貿合作已過了試驗期，應邁向機制化的階段，以早日發揮實質效能，來擴大兩岸共同利益。現在對等的形式下對大陸開放，直接影響了市面上千萬戶小型商戶，所以馬政府在開放中設了防火牆，尤其對中資進入台灣諸多設限。
大陸不可能永遠對台讓利，在服貿平等的原則下有得亦有失乃正常現象，只是在簽訂這些經貿協議時，政府難免和政治效應掛鈎，就如ＥＣＦＡ被執政黨列為首要政績，並藉此接連贏得近年重要選舉。今後應少政治多經濟，多算「經濟帳」強調經濟規律及市場法則，依ＷＴＯ規章必須開放的項目無可迴避，化解情緒化的反彈。