太平島是南沙群島最大的島嶼，而且是唯一有淡水可供居住的島嶼，屬於台灣所有。台灣政府在太平島上建有機場，小型飛機可以起降，諸多台灣政治人物都曾登上太平島，宣示南海主權。過去，太平島有國軍駐守，到陳水扁時代放棄駐軍，而改由海巡署來管理，故軍力不逮。現在，有呼聲希望當局恢復太平島駐軍，但台灣改為募兵制後，由於該島遙遠，加上生活困難，難以募兵前往，更遑論加強軍事防衞。
在台菲為廣大興號事件爭執不休之際，為強化台灣第一線武力部署，海巡署正式推動太平島碼頭的擴建工程。目前，太平島只有老舊的棧橋碼頭，只能靠泊快艇或多功能巡緝艇等平底式小艇，未來碼頭擴建完工後，可停靠五百至一千噸的大型船艦，包括導彈快艇都可停泊。不過，太平島距離台灣太遠，這遠距離工程建起來耗時費日，難以立即達到串聯太平島、東沙、西沙群島，以宣示主權掌握軍權的功效。
太平島碼頭增建，從評估到實際開工時間長達兩年，除環保因素外，最大關鍵在於南海局勢複雜。去年台灣在太平島部署八門火炮遭美方高度關注，這次碼頭的增建亦是如此，美國擔心太平島成為兩岸共同的據點。
對於太平島，台灣一直展現對疆域的延遠權，加強對太平島的興建，空軍希望將太平島的跑道擴建延長，以提高飛機的起降安全；國防部也針對南海問題成立「西太平洋小組」。
菲律賓、越南船隻過去經常越界入侵太平島海域作業，擺明公開挑釁。目前島上只有海巡署駐守，軍力不足以驅逐越界船隻，兩岸不妨以太平島的駐守作為合作起點。大陸在南海的基地，距離太平島較近，兩岸至少可共同維護太平島及南海的漁權。