過去台菲之間有海上救援合作機制，並曾進行演習，代表台菲在進行救難事件上可達致互助目標。
菲律賓公務船冷血射殺台灣漁民，群情激憤，強烈譴責菲律賓的罪行，但在激情過後必須冷靜思考之，今後如何避免此類事件重演，立法院要求政府採取有效之護漁行動，並對菲律賓嚴厲制裁。
台灣的最新民調顯示，百分之八十八的人希望軍艦能常態的巡邏，保護漁民外，亦可彰顯主權。台灣民眾認為軍艦定期巡邏領海海域是必要之舉，讓漁民得以安心作業，亦可減少海上糾紛，同時有阻絕類似海盜行為的肆虐，台灣國防部門對此還未作出回應，評估常態化巡邏的利弊得失，亦擔心中共也以護漁為名而進入了台灣捕魚的海域造成困擾，北京縱使想互助也應考慮到台灣的憂慮。
菲律賓回應台灣提出的要求相當傲慢，在台灣對付菲律賓手中的牌有限之際，台灣內部對兩岸着手共同對付菲律賓政府的聲浪變得更大，也拋棄了過去的疑慮，有近七成的民眾支持兩岸合作施壓菲律賓政府，支持兩岸合作者的數字大幅上升，民氣可用，可為兩岸合作創造契機。
現台菲雙方沒有談攏的是賠償問題，菲律賓不能誠懇以對，更無悲天憫人之心來照顧受難漁民，台灣政府當局就應先發補償金給受害漁民的遇難家屬，然後政府再向菲求償，若等待菲律賓向受害者家屬賠償，恐曠日費時，對受害者家屬更是精神折磨，台灣有八成的民眾贊成政府應先處理之。
此漁船事件已提升至外交層次，就應由政府的高度來處理，高達六成五的民眾贊成武力扣押逞兇菲船，實有運作上的困難，菲不可能交出，台灣應以外交方式解決，民粹的報復手段非有效處理方式。