心臟不同部分的肌肉處於同步協調的狀態，依照次序收縮及放鬆，才能有效將血液傳至全身。房顫則是心房肌與心臟其他部分的肌肉不協調，造成心房跳動過快而且不規則，結果減低心臟泵出血液的流量。此外，房顫所造成的不規律心跳，可能會使心臟出現血凝塊，血塊有機會隨血液到身體各部分，當停留在腦部，使腦部血管栓塞時，便有可能引致中風。
目前控制房顫的主要目標有兩個：其一是控制心跳速度及心律，其二是防止中風。控制心跳速度的藥物能減慢心跳，從而減低心肌不協調的機會。
可是，由於心律並不是完全受控，故此仍有機會出現血塊。控制心律有兩種方法：做手術或利用藥物穩定心房的電流，以預防房顫發作。
防止中風的藥物有兩種，分別是力度較低的抗血小板藥阿士匹靈，以及力度較強的抗凝血藥（俗稱薄血藥）。醫生會根據中風風險分數及病人的個人情況來決定用藥。力度較強的薄血藥並不一定是房顫病人最好的選擇，因傳統薄血藥（如華法林）雖能有效減低中風機會，但病人需定期驗血和調校劑量，同時該藥又與多種食物（尤其是深綠色蔬菜）、藥物及中藥相沖。
現時香港市面已經推出新一代的薄血藥，好處是毋須經常驗血以調校劑量，亦暫時未有發現與食物及中藥相沖；壞處則是會引起其他副作用，如胃部不適等。另外，萬一出現嚴重出血暫時沒有立即有效還原的藥物來抵銷凝血效果，價錢亦比華法林昂貴。如對上述藥物有任何查詢，請立刻向藥劑師查詢。
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