台灣宜蘭漁民組成船隊，七十多艘漁船浩浩蕩蕩地前往釣魚島海域示威，並由海巡署的海巡船護航，場面壯觀，頗令大陸人民感動，認為是兩岸聯手共同護衞釣魚島。其實，兩岸訴求各有不同，故不能稱此是聯手的作為。
漁船出發前舉行說明會，蘇澳漁會理事長陳春生帶領喊口號「為生存，護漁權」，宣示護漁決心。由此可見，台灣漁船出海旨在宣示漁權而非護主權，這是兩岸保釣動機目的之最大不同。
馬英九對這次的漁船護漁行動發聲奧援，申訴台灣漁船在釣魚島海域捕魚，現在經常受到日本海上保安廳的干擾，讓漁民們非常憤怒。他強調，若此一問題不解決，台日雙方很難坐下來討論其他問題。
台灣與日本之間有許多的恩怨情仇，有關釣魚島問題更是爭議的來源。一九四五年日本戰敗後，按照國際公約，將台灣與釣魚島還給了中華民國，因之台灣宣示主權乃有所本。
馬英九當年的博士論文即是釣魚島的問題。他指出，釣魚島的日名「尖閣諸島」，其實來自一名英國船長的命名。百年來，台灣漁民一直在釣魚島海域捕魚，日本統治台灣五十年期間，也指定釣魚島列嶼是台灣漁民的漁場，但現在台灣漁民到釣魚島這個漁場捕魚，受到日本保安廳粗暴的干擾，對此事感到非常憤怒。
馬英九主張以和平方式解決國際爭端，「國家主權無法分割，但天然資源可分享」，馬英九希望相關各方能擱置主權爭議，共同開發東海資源。相較於大陸各地反日的激情，馬英九堪稱是務實派，以和平為號召，維護漁權共同開發資源。
東海複雜的情勢一觸即發，日本、大陸以至台灣都有不同主張，但維持東海和平穩定的局勢，應對三方都有利。