連戰參加亞太經合會領袖會議，就南海議題表示，為了南海的爭端，相關各方不要再耽擱，應盡速討論「南海行為準則」，而台灣絕對是應該受邀參與討論的主體。
連戰的講話反映了台灣的困境，台灣擁有南沙群島，且在最大的太平島駐有國軍，並有機場建設，近期更準備加長跑道以便大型軍機起降，這實質的佔有是毋庸置疑的。但是在南海爭端上，北京不能讓台灣一起參與主權爭議的探討，將台灣排除在外，讓台灣實質擁有太平島但在國際間卻未能有話語權，情何以堪。
連戰抓住亞太經合會的機會向北京要價，連戰認為，東海乃至南海主權，解決辦法在ＡＰＥＣ期間都與相關經濟體談判，在南海議題部分，相關各方已發表過「南海行為宣言」就應盡速討論，而台灣作為「中華台北」的代表就應邀台參與。
連戰在ＡＰＥＣ期間也重申「主權在我、擱置爭議、和平互惠、共同開發」原則，台灣以和平為出發點來共同解決東海及南海爭端，馬英九也倡東海行為準則的建立與南海行為準則相互呼應，處理上應有一貫性，台灣不能被排除在外。
由東海與南海的爭端伊始，台灣感受到北京唯我獨尊的處理態度，雙方的認知有差距，台灣希望以此立足國際展現存在的價值，而北京擔心台灣以此議題走上國際舞台成為獨立的實體，因之口中呼籲合作，實質上卻將台灣排除在外，讓台灣頗有失落感。
「兩岸一中」若只有北京可以有話語權，將造成台灣的疑慮，因之馬英九強調決不與大陸聯手保釣及保太平島。北京在此議題上應有更靈活的策略，滿足台灣的要求，同時為兩岸共同對外而創造契機，此即為兩岸政治軍事互信的開始。