釣魚島列嶼爭執，在日本的「購島」與「國有化」下讓爭端愈演愈烈，日本的種種作為危害了兩岸聲稱的主權擁有，中國與日本的一場奪島大戰已迫在眼前。
於此爭端危機之際，馬英九提出「東海和平倡議」，為解決東海問題開啟了一扇和平之窗，提升了國際形象，有正面積極的意義。
馬英九上台後一直強調台灣要擺脫過去陳水扁執政時的「麻煩製造者」的形象，而要成為和平的締造者，因之在南海及東海的問題上都抱持着「主權在我，擱置爭議，和平互惠，共同開發」的十六字箴言，畢竟對這歷史遺留的問題不能即時迎刃而解，在共同的利益下，合作開發亦不失解決眼前問題的良策，希望能獲得中國大陸與日本的支持。中華民國政府曾在一九九六年召開「釣魚島專案小組會議」，制訂處理釣魚島問題的四項原則，即「堅決主張擁有釣魚島主權，以和平理性方式解決問題，不與中國大陸共同處理，優先維護漁民權益」，這決議的時代背景是在李登輝主政，與大陸交惡之際，當然作出不與大陸合作之決定。今兩岸關係改善，「東海和平倡議」需要北京的唱和，釣魚島是中華民族的利益，兩岸不能合作，但也不必相互排斥，更不必向美日作出保證不會與大陸合作。外交的藝術是要保持模糊的空間，釣魚島爭端波譎雲詭，不必太快下斷語，更應讓日本了解主權問題不容妥協的立場。
釣魚島海域若因日本的挑釁發生動亂，將威脅台海安全，台灣內部應取得朝野維護主權的共識，一致對外，而非在大國中選邊站，避免讓台灣捲入強權的鬥爭，只有以和平方式共同開發是目前解決爭端的最佳方式，讓台灣參與締造區域和平。